Od 1 stycznia 2018 r. wszyscy czynni podatnicy VAT mają obowiązek przekazywania informacji o ewidencji VAT w formie JPK_VAT.
Natomiast od 1 lipca 2018 r. wszyscy przedsiębiorcy prowadzący księgi podatkowe przy użyciu programów komputerowych będą zobowiązani do przekazywania - na żądanie organu podatkowego - pozostałych struktur JPK, np. JPK_FA, tj. pliku JPK dotyczącego faktur. Obecnie obowiązek taki mają wyłącznie duzi przedsiębiorcy.
Odnosząc się do obowiązku przekazywania pozostałych struktur JPK Ministerstwo Finansów (dalej: MF) wyjaśniło (patrz: www.mf.gov.pl - serwisy MF - Dla mediów), że kluczowe jest kryterium prowadzenia ksiąg podatkowych papierowo lub elektronicznie. MF wyjaśniło, że jeżeli podatnik prowadzi księgi podatkowe papierowo, to nie będzie musiał tworzyć JPK_FA ani innych struktur (np. obrotu magazynowego JPK_MAG) na żądanie organu podatkowego. Wówczas organy podatkowe będą żądały podczas kontroli jedynie dokumentów papierowych. Ponadto MF wyjaśniło, że:
- organy podatkowe będą działać racjonalnie i że zależy im zwłaszcza na tym, aby duże podmioty przekazywały dane w formie elektronicznej - w stosunku do najmniejszych podatników, którzy wystawiają zaledwie kilka faktur miesięcznie, najczęściej prowadzone są czynności sprawdzające; przeprowadzając je, organ podatkowy nie będzie czekał na elektroniczne zestawienie kilku faktur w formie JPK_FA, tylko poprosi o nie w takiej formie, w jakiej posiada je podatnik (np. papierowej, skanu itp.);
- jeśli podatnik prowadzi księgi w formie elektronicznej oraz archiwizuje papierowe faktury w postaci skanów, to będzie musiał generować JPK_FA na żądanie organu podatkowego - fakturą w formie struktury logicznej nie jest ani skan, ani PDF (którego nie można edytować), ale dane, które można przetwarzać;
- podatnicy mogą spodziewać się pierwszych żądań organów podatkowych dotyczących przekazania JPK_FA dopiero na przełomie sierpnia i września (po złożeniu deklaracji VAT za lipiec 2018 r.);
- pomimo, iż niektóre firmy informatyczne czy biura rachunkowe informują swoich klientów, że muszą kupić specjalne oprogramowanie do e-fakturowania, to jednak nie ma takiego obowiązku (choć oczywiście można kupić oprogramowanie od producenta czy skorzystać z pomocy biura rachunkowego w tym zakresie);
- alternatywą do wysłania JPK_FA będzie możliwość zgrania pliku np. na pendrive lub płytę CD i przekazania w taki sposób danych pracownikom organu podatkowego,
- nie planuje się w przyszłości zobowiązać podatników do prowadzenia ksiąg podatkowych w formie elektronicznej lub do wystawiania wyłącznie e-faktur (aby każdy miał obowiązek sporządzania wszystkich JPK na żądanie), choć wydaje się, że w XXI wieku naturalne jest zastępowanie form papierowych dokumentami elektronicznymi.
MF podkreśliło także, że od lipca 2018 r. zostanie rozszerzona funkcjonalność bezpłatnej aplikacji e-mikrofirma (służącej obecnie do tworzenia ewidencji i generowania pliku JPK_VAT) o możliwość wystawiania, przesyłania faktur i tworzenia ewidencji fakturowej. Program pozwoli użytkownikowi wystawić fakturę, wydrukować ją lub zapisać na komputerze oraz będzie umożliwiał sporządzenie zestawienia wszystkich wystawionych faktur w danym okresie. Jeśli podatnik korzystający z e-mikrofirmy i wystawiający faktury w tej aplikacji otrzyma wezwanie do przekazania JPK_FA za dany okres, to będzie on mógł bardzo szybko wygenerować JPK_FA. MF wyjaśniło, że aplikacja umożliwi wskazanie okresu (daty początkowej i końcowej), za który ma zostać sporządzone zestawienie faktur oraz pozwoli zapisać takie zestawienie i JPK_FA na dysku albo wysłać plik do urzędu skarbowego. MF zastrzegło jednak, że aplikacja e-mikrofirma nie będzie pozwalała na tworzenie innych struktur JPK niż JPK_FA oraz JPK_VAT.